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  • 本发明提供一种基于大规模基因表达数据的生物医学任务执行方法及装置,涉及生物信息学技术领域。其中,基于大规模基因表达数据的生物医学任务执行方法包括:获取与目标生物医学任务关联的待预测样本;待预测样本是根据不同健康状态下的转录组测序数据之间的差...
  • 本发明公开了一种基于多重验证的PCR熔解曲线分析方法及系统,其中涉及的分析方法,包括S1.获取PCR反应板各通道各孔位的数据信息,生成各通道各孔位的初始熔解曲线;S2.对初始熔解曲线进行平滑处理,并计算一阶导数,生成负导数曲线;S3.计算二...
  • 本发明属于工业微生物监控与发酵工程技术领域,涉及一种基于关键微生物竞争动态的酒糟发酵代谢状态分析方法。本发明方法是通过分析时间序列样本,鉴定出丰度呈现稳定竞争性变化的关键微生物组合,并基于其丰度动态关系判定发酵代谢状态的转换;所述关键微生物...
  • 本发明提供了一种基于单细胞核转录组学技术的高原家畜睾丸支持细胞和生殖细胞互作的分析方法,属于生物信息学技术领域。所述分析方法,以不同发育阶段的高原家畜睾丸组织为材料进行单细胞核转录组测序,根据标记基因划分支持细胞亚群和生殖细胞亚群,绘制拟时...
  • 本发明涉及嵌合体变异检测技术领域,具体涉及一种基于深度学习的NGS数据嵌合体变异高效检测方法。本发明对于任一生物样本,将NGS数据中的测序读段与预设参考基因组进行比对,获得每个比对变异位点的变异等位基因频率,筛选出有效变异位点;对于任一预设...
  • 本发明涉及鱼类监测技术领域,特别是基于水体eDNA样本识别的珍稀鱼类无损监测方法及系统。通过历史eDNA采样分布构建热点模型,实现采样热点转移预测并确定最佳采样点位;结合高通量测序与碱基序列识别决策树,对序列稀有度进行判别并检索珍稀鱼类;进...
  • 本发明涉及生物信息学与基因组测序数据处理技术领域,具体为胃癌致病基因序列的生物信息比对分析方法,包括:获取目标样本的基因测序数据,加载预设的胃癌多维拓扑参考图,并加载预设的突变特征向量库;生成特征频率分布,与预设的病因学指纹图谱进行匹配以确...
  • 本发明涉及宏基因组学技术领域,公开了一种窖泥宏基因组数据自动化分析方法及系统,旨在解决现有方法存在效率和准确性较差的问题,方案主要包括:接收测序数据类型、文件路径及分析参数;对原始下机数据进行质量控制;进行序列组装,生成contigs文件;...
  • 本发明涉及畜牧养殖与饲料营养技术领域,公开了基于多源数据融合的低蛋白多元化日粮设计方法及系统,其中方法通过PC算法构建配方‑环境‑效果有向因果图,采用反事实推理估算环境因素和配方因素的效果偏差贡献占比,利用逆强化学习推断养殖场目标权重偏好,...
  • 本发明公开了一种基于深度学习鉴定的新型抗菌肽及其应用,涉及生物技术领域,鉴定方法为利用深度学习赋能南大洋微生物宏基因组来源抗菌肽高通量精准挖掘,通过聚焦10条代表性候选抗菌肽cAMP,并采用化学合成策略获得两条作用于酿脓链球菌感染的低溶血活...
  • 本申请所提供的不同基因组之间产生的邻近连接信号判定方法、装置、终端及介质,方法包括:获取多基因组混合DNA样品对应的目标基因组集合,并确定各个基因组的相对丰度以及目标基因组集合的总邻近连接数;基于各个基因组的相对丰度和总邻近连接数估计任意一...
  • 本发明涉及人工智能与生物信息学技术领域,公开了一种基于分层权重感知注意力机制的生物功能特征融合方法。该方法通过获取基因序列数据及多源功能注释,利用预训练模型转换为向量表示;采用权重感知的层次化融合机制,将库内功能语义融合为库级概要向量;构建...
  • 本公开涉及用于癌症早期筛查的方法、装置、设备和产品。该方法包括获取来自受试者的血液的游离DNA。该方法还包括基于游离DNA中的甲基化标志物区域中的多个CpG位点来确定甲基化标志物区域所包含的目标单倍型的数目,目标单倍型指示一组CpG位点具有...
  • 本申请公开了一种个体化基因治疗靶点预测方法及相关装置,通过基因表达数据以及基因依赖效应数据,筛选细胞系样本集合,然后在每个细胞系样本中基因效应值最低的多个基因的共现频率,选择其中的N个基因作为目标靶基因,该目标靶基因为对细胞生长抑制具有重要...
  • 本发明提供了一种基于共享‑特异信息挖掘的多视图空间转录组学聚类方法,解决了现有空间域识别方法中单一视图鲁棒性不足、多视图信息融合不充分、数据统计特性刻画不准的技术问题。其技术方案为:包括以下步骤:S1、获取空间转录组原始数据并预处理;S2、...
  • 本发明公开一种基于元路径增强的多层异质网络单细胞生物网络推断方法,主要包括基因调控知识库增强的多层异质网络构建模块,整合外部基因互作网络及scRNA‑seq、scATAC‑seq、ST等多组学数据,构建含细胞‑细胞、细胞‑基因、基因‑基因关...
  • 本发明提供了一种用于构建临床级呼吸道病原微生物检测基因组数据库的方法,集成了物种高质量基因组序列的筛选、冗余基因组序列去除、基因组错误物种分类、基因组中污染序列过滤等关键功能。
  • 本发明涉及一种结合知识图谱的大语言模型分层式单细胞注释方法及系统。所述方法包括:确定细胞类型节点、基因节点、通路节点以及节点之间的各个有向关系,构建生物学知识图谱;获取待注释单细胞簇的标记基因列表输入至大语言模型中,通过大语言模型生成至少一...
  • 本发明涉及材料科学领域,公开了一种基于碳化硅多晶核晶向识别数据的动态演变分析方法,用于碳化硅异质结半导体材料分析,包括:创建碳化硅异质结的分子动力学仿真模型,根据环境参数生成异质结模型;执行分子动力学仿真,模拟不同温度下的原子间相互作用产生...
  • 本发明涉及一种基于微观反应分子动力学的动态烧蚀预示方法,通过不同材料反应分子动力学方法(RMD)的微观尺度模拟计算和其表面微观结构,构建动态条件下碳碳烧蚀模型、碳酚醛烧蚀模型与碳碳化硅烧蚀模型。本发明对多物理场耦合计算进行了优化,能够得到飞...
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