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基于显微共聚焦拉曼技术的食源性微生物特征指纹数据库、智能分析平台及应用
本申请公开了一种基于显微共聚焦拉曼技术的食源性微生物特征指纹数据库、智能分析平台及应用,涉及食品安全检测领域;该食源性微生物特征指纹数据库的构建方法包括为目标菌株生成唯一菌株ID,获取关联数据;建立唯一菌株ID与关联数据之间的映射关系;基于...
一种标准化合物库MetaTag数据库及其应用
本发明公开了一种标准化合物库MetaTag数据库及其应用,其中,所述MetaTag数据库收录43120个化合物,所述化合物具有“Xm‑Yn”型的化学结构特征,其中,X代表亲电取代基,Y代表亲核取代基,m和n分别代表X和Y的数量,连字符“‑”...
基于单核苷酸多态性的农作物品种分类方法、装置和设备
本发明提供一种基于单核苷酸多态性的农作物品种分类方法、装置和设备,涉及农作物分析技术领域,该方法包括:针对各目标农作物样本,对目标农作物样本进行基因测序,得到目标农作物样本对应的高置信度基因序列数据;基于高置信度基因序列数据确定目标农作物样...
一种酒醅中金山醋酸乳杆菌的数量预测方法
本发明属于白酒分析领域,涉及一种酒醅中金山醋酸乳杆菌的数量预测方法。本发明提供的方法,基于梯度提升决策树模型,通过获取酒醅样本的取样时间点、水分含量、温度、乳酸含量和淀粉含量,对酒醅样本中的金山醋酸乳杆菌数量进行预测。其中,所述淀粉含量由乳...
一种染色质可及性与转录因子交互深度学习方法
本发明属于生物信息学领域,具体涉及一种染色质可及性与转录因子交互深度学习方法。首先,提出一种基于深度学习的基因表达预测框架,通过构建细胞×转录因子×染色质区域的三维交互张量模拟顺式调控作用;其次,设计包含可学习交互权重矩阵的神经网络,利用注...
一种多模态空间组学数据的融合方法、装置及系统
本发明涉及数据融合处理技术领域,尤其是涉及一种多模态空间组学数据的融合方法、装置及系统,本申请提供的一种多模态空间组学数据的融合方法、装置及系统,该方法包括:对来自第一平台蛋白成像数据进行标准化格式转换,生成包含通道优先维度和像素物理尺寸信...
单细胞转录组瞬时变化向量预测方法、系统及装置
本申请提供了一种单细胞转录组瞬时变化向量预测方法、系统及装置,包括获取单细胞转录组数据和对应的时间点标签;基于时间点标签和单细胞转录组数据,生成用于模型训练的监督标签;构建半监督学习模型;利用训练好的模型预测每个细胞的基因表达瞬时变化向量。...
一种基于三元图混合架构与困难样本挖掘框架预测miRNA-疾病相互作用方法
本发明提出一种基于三元图混合架构与困难样本挖掘框架预测miRNA‑疾病相互作用方法,解决现有方法仅建模miRNA‑疾病二元关系、样本失衡及评估易数据泄露的问题。方法包括:融合miRNA、疾病、lncRNA多源相似度数据,结合已知关联构三元异...
一种基于函数空间正则化的可信药物靶标预测方法
本发明公开了一种基于函数空间正则化的可信药物靶标预测方法,涉及药物研发技术领域,本发明包括:收集药物分子与EGFR突变体的相互作用数据及特征数据;构建药物相似性图和靶标相似性图;定义双线性预测函数和损失函数;引入基于双图卷积的函数空间正则化...
一种干细胞数据的处理方法和系统
本发明公开了一种干细胞数据的处理方法及系统,其中方法包括对待处理的批量干细胞样本进行特征提取处理,得到多维形态特征参数,并基于多维形态特征参数生成第一散点图、第二散点图和第三散点图;分别对第一散点图、第二散点图和第三散点图进行过滤处理,得到...
非编码RNA-疾病关联预测方法、装置、设备及存储介质
本申请公开了一种非编码RNA‑疾病关联预测方法、装置、设备及存储介质,运用于生物信息技术领域,其方法包括:构建异构生物网络,基于异构生物网络采用图神经网络分别从网络拓扑结构和实体属性特征中学习生物实体的分布式表示,并通过注意力机制融合不同视...
基于单细胞组学与孟德尔随机化的乳腺癌异质性分析系统
本发明公开了基于单细胞组学与孟德尔随机化的乳腺癌异质性分析系统,涉及生物信息技术领域;包括:数据获取模块、单细胞数据处理模块、差异表达分析模块、孟德尔随机化分析模块、生存分析模块、功能富集模块、药物预测模块和输出模块;所述系统用于整合多组学...
一种基于重测序数据筛选高质量SSR分子标记的方法
本发明公开了一种基于重测序数据筛选高质量SSR分子标记的方法,包括:获取目标物种的参考基因组数据和全基因组重测序数据;对所述参考基因组数据进行SSR分子标记开发,得到SSR基础位点信息;基于所述全基因组重测序数据,执行变异检测流程,生成包含...
基于转录组数据的大豆开花时间预测方法及系统
本发明提供了基于转录组数据的大豆开花时间预测方法及系统,涉及生物医学工程技术领域,所述方法包括:采集大豆转录组表达数据构建基因表达状态空间,对不同样本表达演化方向一致性分析,预设的大豆基因调控关系构建基因调控结构约束模型,将转录组表达数据进...
一种基于样条回归模型和整体熵变的心衰关键基因识别方法及系统
本发明公开了一种基于样条回归模型和整体熵变的心衰关键基因识别方法及系统。所述方法包括:一、数据预处理;二、时序差异表达分析;三、动态共表达网络构建;四、网络整体熵变分析;五、心衰关键基因筛选。本发明提出了整合时序动态与网络整体分析的新思路:...
基于多模态特征的信号肽类别与切割位点预测方法及系统
本发明提出了基于多模态特征的信号肽类别与切割位点预测方法及系统,属于生物信息分析技术领域。方法包括:获取信号肽样本的氨基酸序列,并利用蛋白质结构预测模型获取信号肽的三维结构数据;获取信号肽氨基酸序列的序列模态输入数据,并构建结构图,得到结构...
一种蛋白质-小分子结合位点预测方法
本发明属于计算机与生物信息学技术领域,涉及一种蛋白质‑小分子结合位点预测方法,具体涉及一种基于实时特征解耦与证据深度学习的蛋白质‑小分子结合位点预测方法。获取目标蛋白质的氨基酸序列,并为每个残基生成稠密嵌入向量;解耦处理生成稀疏特征,提取任...
异常检测方法、计算机设备及计算机可读存储介质
本公开提供一种异常检测方法、计算机设备及计算机可读存储介质,该方法包括:获取在当前测序循环中对各个成像视野处的样本文库进行图像采集得到的测序图像;从当前测序循环的测序图像中提取出与基因测序设备中的至少一个目标模块对应的当前特征数据,并基于当...
一种开发贝类种质资源评估分子标记的方法
本发明提供了一种开发贝类种质资源评估分子标记的方法,属于贝类种质资源评估、保护、开发领域。该方法包括:收集待评估群体的个体并在全基因组水平开展高通量测序,获取全基因组遗传变异位点,针对测序数据比对质量、基因型分型质量、测序深度、基因型信息缺...
混合文库配对读段基因组类型检测方法及相关产品
本公开提供一种混合文库配对读段基因组类型检测方法及相关产品,该方法的具体实施方式包括:对于待测配对读段的至少一个读段执行以下特征提取操作:对于该读段中的每个候选胞嘧啶位点,根据该候选胞嘧啶位点所在的二核苷酸上下文,确定该候选胞嘧啶位点是否为...
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