香港中文大学(深圳)刘瑾获国家专利权
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龙图腾网获悉香港中文大学(深圳)申请的专利一种空间转录组数据的降维方法及系统获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN116705151B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-05-01发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202310674214.6，技术领域涉及：G16B20/00；该发明授权一种空间转录组数据的降维方法及系统是由刘瑾设计研发完成，并于2023-06-08向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种空间转录组数据的降维方法及系统在说明书摘要公布了：本发明公开了一种空间转录组数据的降维方法及系统，属于数据分析技术领域，能够解决现有降维方法计算复杂度较高，无法同时对多个切片进行空间降维的问题。所述方法包括：步骤1、获取空间转录组数据中多个切片的基因表达矩阵及空间坐标矩阵；步骤2、根据基因表达矩阵及空间坐标矩阵，确定初始降维参数及每个切片中spot之间的空间相依性；步骤3、根据基因表达矩阵、初始降维参数及切片中spot之间的空间相依性构建降维模型；步骤4、利用迭代优化算法估计降维模型的参数，得到每个切片的最终低维表示。本发明用于空间转录组数据的降维。
本发明授权一种空间转录组数据的降维方法及系统在权利要求书中公布了：1.一种空间转录组数据的降维方法，其特征在于，所述方法包括： 步骤1、获取空间转录组数据中多个切片的基因表达矩阵及空间坐标矩阵； 步骤2、根据所述基因表达矩阵及所述空间坐标矩阵，确定初始降维参数及每个切片中spot之间的空间相依性； 步骤3、根据所述基因表达矩阵、所述初始降维参数及所述切片中spot之间的空间相依性构建降维模型； 步骤4、利用迭代优化算法估计降维模型的参数，得到每个切片的最终低维表示； 所述步骤2具体包括： 步骤21、根据所述基因表达矩阵，利用主成分分析方法确定初始降维参数和每个切片的初始低维表示； 步骤22、根据所述空间坐标矩阵和所述每个切片的初始低维表示确定每个切片中spot之间的空间相依性； 所述切片中spot之间的空间相依性具体为： 在给定所述切片中目标spot外的所有spot样本的低维表示的条件下，所述目标spot的低维表示服从正态分布；其中，正态分布的均值为所述目标spot的邻居的低维表示的平均值。
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