上海宏序生物科技有限公司;河北医科大学第一医院周春华获国家专利权
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龙图腾网获悉上海宏序生物科技有限公司;河北医科大学第一医院申请的专利一种靶向测序的病原体-耐药基因同步检测方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN121617467B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202610141861.4,技术领域涉及:G16B20/30;该发明授权一种靶向测序的病原体-耐药基因同步检测方法及系统是由周春华;于静;赵媛媛;刘琰;浦浩;黄文潘;白茹;刘章;陈金萨设计研发完成,并于2026-02-02向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种靶向测序的病原体-耐药基因同步检测方法及系统在说明书摘要公布了:本发明涉及生物医学工程技术领域,具体涉及一种靶向测序的病原体‑耐药基因同步检测方法及系统,通过构建关于病原体和耐药基因的复合知识图谱,并基于该复合知识图谱,确定待检测临床样本中存在的目标病原体的病原体基因序列与耐药基因序列之间的重叠率,分析目标病原体的病原体基因序列和耐药基因序列的序列抑制敏感性,并结合复合知识图谱,构建协同状态演化模型,从而利用卡尔曼滤波算法获取耐药基因序列的最优抑制强度因子,利用该最优抑制强度因子对重叠率进行校正,并最终确定所有病原体基因序列中的耐药基因序列及其基因丰度。本发明有效提高了耐药基因的检测精度。
本发明授权一种靶向测序的病原体-耐药基因同步检测方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种靶向测序的病原体-耐药基因同步检测方法,其特征在于,包括以下步骤: 基于不同病原体的基因组序列信息和耐药基因序列信息,构建关于病原体和耐药基因的复合知识图谱; 基于所述不同病原体的基因组序列信息,识别待检测临床样本中存在的目标病原体以及所述待检测临床样本中存在的所述目标病原体的病原体基因序列; 基于所述复合知识图谱,确定所述目标病原体可能存在的耐药基因序列集合,并将所述病原体基因序列与耐药基因序列集合中的耐药基因序列进行比对,得到所述病原体基因序列与所述耐药基因序列之间的重叠率; 分析所述目标病原体的所述病原体基因序列和所述耐药基因序列的序列抑制敏感性,并结合所述复合知识图谱,构建协同状态演化模型,所述协同状态演化模型通过引入抑制强度因子作为隐变量来表征PCR扩增受抑程度,并利用卡尔曼滤波算法,基于所述协同状态演化模型确定的状态先验估计,并结合状态观测值进行残差更新,通过迭代逆向估计以确定所述耐药基因序列的最优抑制强度因子; 利用所述最优抑制强度因子,对所述重叠率进行校正,并基于重叠率校正值,确定所有所述病原体基因序列中的耐药基因序列及其基因丰度。
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